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Fases del dx molecular
Obtención DNA - PCR - Electroforesis
Pasos de obtención del DNA
Obtención(lisis celular), purificación, cuantificación
Obtención rapida de DNA
LISIS TERMICA
Del cultivo lo pones en 50-100microlitros de agua esteril calientas a 95-100•C , centrofugas 30s- 5min y ll almacenas a 4-20 •C
Purificación de DNA
Extracción/precipitación--> fenol/cloroformo
Componentes de PCR
Muestra
Buffer 10x
MgCl2 a cofactor de adn polimerasa
dNTPs -- A, G, C, T
Primers
Polimerasa
H2O
Fases de PCR
1.- 95•C desnaturalización
2.- 50•C alineamiento
3.- 72•C extensión
Desnaturalización
Alineamiento
Extensión
Recomendaciones PCR
No mas de 40 ciclos
Reactivos en frio
Materiales consumibles nuevos y esteriles
Etapas de electroforesis
1.- obtención de muestra
2.- preparar gel de agarosa
3.- preparación de muestras con el buffer carga.
4.- carga de las muestras
5.- corrida del gel
6.- teñido del gel
7.- visualizar gel con luz uv
Electroforesis voltaje aplicado
Velocidad de migracion es proporcional al voltaje aplicado
Gold standar del disgnostico molecular
Electroforesis
Desventajas de PCR
Iniciadores especificos
Limitaciones del tamaño a amplificar
Errores de replicacion
Que se contaminen
Costoso
Tecnicas derivadas de PCR
Semianidada
Transcriptasa reversa
Múltiple
RFLP
Tiempo Real
Secuenciación
PCR semi-anidada
Dos rondas de amplificación con dif primers para mas especificidad
•1era- primers externos- secuencia extensa
•2da- primers internas- región especifica
PCR semi-anidada
Dos rondas de amplificación con dif primers para mas especificidad
•1era- primers externos- secuencia extensa
•2da- primers internas- región especifica
Polimorfismos de Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLP)
Variación en la secuencia de ADN
PCR multiple
Amplificacion de varias secuencias de forma simultanea
PCR tiempo real
•Al tiempo que amplifica cuantifica el producto de amolificacion
• Es un PCR pero con fluoróforo
•Rapido diagnostico
PCR transcriptasa reversa
A partir de cDNA de RNA
2 enzimas: transcriptasa reversa termolábil y DNA polimerasa termoestable
Secuenciacion
Identificar segmentos cortos de DNA dividiendo fragmentos pequeños
Gene Xpert
Solo detecta a mycobacterium tuberculosis y resistencia a rifampicina
NO DETECTA MYCOBACTERIAS ATIPICAS