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composition del collagen
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tres cadenas alfa (polipéptidos de hasta 1000 a.a) entretejidos en una triple hélice semejante a una cuerda, las tres cadenas se mantienen juntas por enlaces de hidrogeno intercatenarios
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collagen tipo 1 y 2
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tipo 1 es el mas comun: dos cadenas, alfa 1 y 2 (tendones y córneas)
tipo 2: tres cadenas alfa 1,2,3 (estructuras cartilaginosas) tipo 3: vasos sanguíneos->hay distensión |
tipos de colageno que forman fibrillas
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1,2,3
arreglo escalonado |
tipos de colageno que forman redes
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4,8
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tipos de colageno que están relacionados con fibrillas FACIT
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9,12
fibrils unidas a otros componentes de la matriz extracelular |
secuencia de a.a del colageno
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rico en prolina (causa torceduras, no hay formación de hélice alfa)
rico en glicina (esta en cada 3 posición) Gly-Pro-Hyp .... (Gly-X-Y)333 Y puede ser hidroxiprolina/ hidroxilisina |
hidroxiprolina y hidroxilisina
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prolil hidroxilasas (dependen de Vit C) hidroxilan residuos de prolina y lisina
hidroxiprolina->ayuda a que sea polar y forme puentes de H intercatenarios y se estabilice la triple hélice |
glucosilacion de la hidroxiprolina
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el grupo hidróxilo puede glucosilarse, glucosa y galactosa se unen antes de a formación de la triple hélice
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pasos de la biosíntesis de colageno
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1. sintesis de cadenas alfa-traduccion de ribosomas
2. formacion de precolageno-puentes de H intercatenario 3. hidroxilacion del 3er residuo de a.a-enzimas dependientes de vit C, oxigeno, hierro ferroso Fe2 4. escision de extremos-peptidasas |
sindrome de Ehlers-danlos SED
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por deficiencia de enzimas que procesan el colageno o mutaciones en la secuencia de a.a de colageno 1,2,3
mas frecuente defectos de colageno tipo 5 |
efecto dominantes negativo
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si se incorpora una cadena mutante puede llevar a la degradación de toda la triple hélice
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tipos de SED
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defecto colageno tipo 5-extensibilidad y fragilidad en piel
defecto colageno tipo 3-mas grave, rotura arterial |
(OI) osteogenesis imperfecta/ enfermedad de huesos frágiles
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mutaciones causan un remplazo de glicina por a.a con cadenas laterales voluminosas
mas frecuente defectos de colageno tipo 1 |
tipos OI
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tipo 1-fragilidad ósea leve, peridida auditiva, esclerótica azul
tipo 2-mas grave, complicaciones pulmonares en periodo perinatal tipo 3-grave, fracturas al nacer, estatura corta, joroba, esclerótica azul |
tratamiento OI
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bifosfonatos, inactivan/aumentan apoptosis de osteoclastos-> descomponen el tej óseo; disminuyen la apoptosis de osteoblastos->depositan matriz ósea nueva
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elastina
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polímero 700 a.a pequeños y no polares, su precursor es tropoelastina; rica en propina y lisina poco hidrosiprolina e hidrolisina
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function lisil oxidasa
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desamina de modo oxidativo cadenas laterales de lisio de polipéptidos de la tropoelastina y se forman residuos de allisina
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sindrome de marfan
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mutaciones en la proteina de fibrilina-1
deficiencias de integridad estructural del esqueleto, ojos, sistema cardiovascular |
función alfa 1-antitripsina
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inhibe enzimas proteoliticas que hidrolizan y destruyen a las proteinas
se produce en hígado |
deficiencia de AAT (alfa 1-antitipsina)
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daños pulmonares, sintomas de enfisema, insuficiencia hepática pediatra terminal
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oxidoreductasas
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catalizan reacciones de oxido-reduction:
NAD---> NADH OH--->H |
transferasas
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transferencia de grupos
serina + THF--> glicina + THF-CH2 glucosa+ATP->glucosa 6-fosfato+ADP *el grupo CH2 estaba en serina y se movió, tienen en sufijo "trans" |
hidrolasas
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rompimiento de enlaces por adición de agua:
ureasa cataliza... urea + H20--->CO2 + 2NH3 |
liasas
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se eliminan grupos para formar un doble enlace o se añaden a un doble enlace
piruvato descarboxilasa cataliza... piruvato---> acetaldehyde +CO2 *rompio el enlace de COO- del piruvato a CO2 |
isomerasas
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reacomodo de isômeros ópticos o geométricos
D-alanina---->L-alanina |
ligasas
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formacion de un enlace entre dos moléculas de sustrato, la energia es aportada por la hidrolisis de ATP
piruvato carboxilasa.... piruvato+HCO3--->oxalacetato |
propiedades de las enzimas
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union al sitio activo causa un cambio conformaciones en la enzima,
kcat=numero de recambio 10^3 hasta 10^8 veces mas rápido, altamente especificas interactuándonosles con 1 o varios sustratos |
holoenzima
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componente proteico de la enzima activa con su componente no proteico
apoenzima + cofactor |
apoenzima
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enzima sin su integrante no proteico=solo proteica,
carece de actividad, carece de cofactor |
cofactor
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si la parte no proteica es un ion metálico, ej. Zn, Fe
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coenzima
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si la parte no proteica es una molécula orgánica pequeña,
se asocian de manera transitoria con la enzima |
grupo prostetico
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la coenzima se asocia de forma permanente con la enzima y regresa a su forma original
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características de las reacciones hablando de enzimas
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son especificas y termodinámicamente favorables
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Ea energia de activacion
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energia que separa a los reactivos y los productos
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T estado de transición
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se forma durante la conversion de reactivo a producto, es muy inestable este y es la máxima energia, no es ni reactivo ni producto en este punto
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relation Ea y velocidad de la reacción
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menor Ea, mayor velocidad de reacción
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cambios de energia debido a la acción enzimática
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energias libres de reactivos y productos quedan iguales
acelera la velocidad de la reacción disminuye la energia de activacion |
estabilización del estado de transición gracias al sitio activo
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se inicia porque el sustrato se une al sitio activo; cuando se estabiliza T la enzima incrementa el reactivo intermediario que puede convertirse en producto y se acelera la reacción
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sitio activo proporciona grupos cataliticos, para que?
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para catálisis general ácido-base en la cual los residuos de a.a. liberan o aceptan protones; o
puede implicar la formación transitoria de un complejo ES covalente |
factores que afectan la velocidad de reacción
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concentration de sustrato
temperatura pH |
curva de cinetica enzimatica de Michaelis-Menten
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la grafica en relación de la velocidad inicial de reacción contra la concentración de sustrato es hiperbólica
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curva de cinetica enzimatica de las enzimas alostericas
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presentan una curva sigmoidea (como Hb)
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efectos de la temperatura a la velocidad de reacción
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incremento de la velocidad hasta que se alcanza la velocidad máxima
disminución de la velocidad por la desnaturalización de la enzima inducida por la temperatura |
importancia de pH en enzimas
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la molécula proteica (enzima/ sustrato) cataliticamente activa depende del carácter ionico (estado ionizado o no ionizado) de las cadenas laterales de a.a
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que demuestra el modelo de Michaelis-menten
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enzima se une de manera reversible con un sustrato->complejo enzima-sustrato->genera el producto->regenera la enzima libre
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ecuación de Michaelis-menten
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velocidad con respecto a la concentración de sustrato
Vo= Vmax (S) / Km (S) *Km= constante de Michaelis (k inversa + k2)/k1= parámetro de afinidad |
la concentration del complejo ES cambia con el tiempo? V/F
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falso, no cambia con el tiempo=suposicion del estado estacionario, se refiere a que la formación ES es igual a la del rompimiento ES
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que es Km
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parametro de afinidad de la enzima por el sustrato,
=Vmax / 2 *no varia con la concentración de enzima; es diferente en cada enzima |
relacion Km y afinidad
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Km alta, baja afinidad, union débil
Km baja, alta afinidad, union fuerte |
S <<< km
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reaction de primer orden
Vo= Vmax/ Km (S) *es proporcional a la concentración de sustrato |
S >>>km
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reaction de orden 0
Vo= Vmax |
en la grafica de dobles recíprocos/ de Lineweaver-Burk, intersecciones en x y y
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intersection en x/ horizontal= -1/ km
intersection en y/ vertical= b = 1/Vmax |
diferencia inhibido reversible e irreversible
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reversible-se unen a las enzimas a través de enlaces no covalentes forman un complejo enzima-inhibidor
irreversible- se unen a las enzimas a través de enlaces covalentes |
efectos con un inhibido competitivo
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-se puede revertir aumentando concentración de S
-Vmax es igual -Km aumenta -misma intersección en el eje y en 1/Vmax (se ven como cruzadas) intersection en eje x se acerca mas al cero que la no inh |
efectos con un inhibido no competitivo
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-no se puede revertir con aumento S
-Vmax disminuye -Km es igual -interseccion en eje y se desplaza verticalmente se forma una V con las dos |
quien regula las enzimas alostericas
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efectores= son moléculas que se unen de modo no covalente en un sitio distinto al activo
hay efectos negativos y positivos |
efectores homotropos
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el sustrato sirve como efector y hay cooperatividad=sus sitios de union cooperan entre si para la union del sustrato, presenta una curva sigmoidea, casi siempre es un efector positivo
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efectores heterotropos
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el efector es una molecula diferente al sustrato, inhibición por retroalimentación negativa=el producto de una ruta inhibe la actividad de la enzima que marca el ritmo de la ruta
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acción de las cinasas
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tipo de modificación covalente= catalizan la adición de un grupo fosfato su proteina o sustrato enzimático, con el ATP como donador de fosfato
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action de las fosfatasas
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enzimas que escinden/ cortan grupos fosfato en las cadenas fosforiladas
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que es mas rapido? regulation alosterica/ covalente o regulation por induccion o represion de las síntesis proteicas
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regulation alosterica/ covalente= rapida=seg a min
regulation por induccion o represion de las síntesis proteicas= lenta= horas a dias |
isoenzima
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variaciones de una enzima, cataliza la misma reacción pero tienen propiedades físicas diferentes
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isoenzimas LDH
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LDH 1-musculo cardiaco
LDH 2-eritrocitos LDH 3 y 4-musuclo y corazón LDH 5-higado y músculo esquelético |
importancia de CK2=MB
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esta en el miocardio y cuando se encuentra en el plasma es debido a un daño del miocardio
CK1=cerebro CK3=musculo cardiaco |
que vitaminas son precursores de coenzimas
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vitaminas hidrosolubles y vit k (liposoluble)
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function de B9/ acido fólico
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metabolismo monocarbonado (acepta y luego dona C); biosíntesis de compuestos como:
-nucleotido de purina para ADN -timidina monofosfato TMP -metionina a partir de homocisteina -a.a (serina) |
forma reducida/ activa/ coenzimatica de B9
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dihidrofolato reductasa forma THF Tetrahidrofolato=es la forma activa
*esta enzima puede ser inhibida por-metotrexato |
deficiencias de acido folico
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DTN defectos del tubo neural
anemia megaloblastica-baja síntesis de TMP y nucelotidos de purinas... impiden la síntesis de ADN *megaloblastos-acumulacion de precursores inmaduros |
causa anemia microcitica
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deficiencia de hierro, (B6) piridoxina, ascorbato (vit C)
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causa anemia macrocitica
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deficiencia B9 acido folico (folato), B12 (cobalamina)
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function de B12/ cobalamina
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remetilacion de la homocicsteina a metionina y la isomerizacion se la metilmalonil-coenzima A producida en la degradación de a.a y FA con números impares de carbono
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estructura B12/ cobalamina
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Co en el centro del anillo de corrina gracias a la union de nitrógenos del pirrol
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forma activa de B12
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metilcobalamina y 5´desoxiadenosilcobalamina
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forma comercial B12
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cianocobalamina
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proceso de absorción de B12
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ingesta->B12 se une a proteina R->se suelta proteina R y se une a FI factor intrinseco->se une a un receptor en la mucosa del ileon->proteina transportadora (transcobalamina) la lleva a la circulación
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causa de anemia perniciosa
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malabsorción de B12, por una destrucción autoinmune de células parietales gástricas que sintetizan FI factor intrínseco
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funciones vitales C/ acido ascórbico
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agente reductor en reacciones de hidroxilacion,
hidroxilacion de prolinas y lisinas del colageno, sintesis de neurotransmisores ej.adrenalina -cicatrizacion de heridas, mantenimiento tejido conjuntivo normal, facilita absorción de Fe mediante la reducción de Fe+3 -->Fe+2 |
causa escorbuto
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deficiencia de vitamina C/ acido ascorbico
*debilidad de fibras de colageno por la falla de hidroxilacion de prolina y lisina |
cuales son los derivados de la piridina
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piridoxina-plantas
pyridoxal-animales piridoxiamina-animales *son precursores de PLP |
forma activa de B6/ piridoxina
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PLP fosfato de piridoxal
-su función es catalizar reacciones en las que intervienen aminoácidos |
que puede producir la ingesta del fármaco isoniazida
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puede inducir una deficiencia de B6 al formar un derivado de PLP
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toxicidad por B6/ piridoxina
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es la unica importante hablando de vitaminas hidrosolubles, causa síntomas neurológicos, y cuando se interrumpe la administración no hay una recuperación completa
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forma activa B1/ tiamina
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TPP pirifosfato de tiamina
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function B1/ tiamina
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transferencia de unidades de aldehido,
coenzima en la formación/degradacion de alfa-cetoles por acción de la transcetolasa; descarboxilacion oxidativa de los alfa-cetoacidos |
formation de forma activa de B1=TPP
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ATP le da un grupo pirifosfato a la tiamina y se forma TPP (pirifosfato de tiamina)
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deficiencia de B1/ tiamina
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beriberi y sindrome de wernicke Korsakoff
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formas activas B3/ niacina
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NAD dinucleotido fosfato de nicotinamida
NADP dinucleotido fosfato de nicotinamida y adenina *funcion-reacciones oxidación reducción |
causa de pelagra
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deficiencia B3/ niacina
-dermatitis, diarrea, demencia, disfunción |
como se genera la forma activa de B3
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NADPH, mediante la oxidación de la glucosa en la via de las pentosas
*requiere tiamina |
forma activa de B2/ riboflavina
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FAD dinucleotido de flavin adenina
FMN mononucleotido de flavina |
function B2/ riboflavina
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transporta 1 o 2 electrones,
ciclo de acido citrico, degradation de a.a y purinas, oxidation de acids grasos, transporte de equivalentes reductores del citosol a la mitocondria para evitar síntesis de ATP |
deficiencia de B2/ riboflavina
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dermatitis, inflammation de lengua, fotofobia, lesiones en las comisuras de la boca
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function B7/ biotina
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reacciones de carboxilacion, portador de CO2 activo; se une covalentemente a residuos de lisina
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hay deficiencia de B7?
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no, pero la ingesta de clara de huevo cruda tiene avidina-glucoproteina que impide la absorción efectiva
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funciones B5/ acido pantotenico
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forma parte de complejos enzimáticos para el transporte de grupos acilo
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que compuestos acarrea B5/ acido pantotenico
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acetil CoA
succinil CoA sintesis de ácidos grasos |
quienes actuan en conjunto de B5 en el inicio del ciclo de acido citrico
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tiamina, niacina y riboflavina
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https://docs.google.com/document/d/1Mxf0bWvr2m6Li0yJVXe8uhN-1t-5kixgIW3pOBRV3FM/edit
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hipotesis
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formas vitamina A
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retinol (origen animal) -forma de almacenamiento
retinal (origen animal)- aldehido por oxidación del retinol, grupo prostetico de opsina acido retinoico- receptor nuclear para transcribir genes B-caroteno (origen vegetal)-conversion ineficiente |
function vitamina A
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mantenimiento de la reproducción,
vision, promotion del crecimiento, expresión genica, diferenciación y mantenimiento de os tejidos epiteliales |
function de vit A en vision
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11-cis retinal-->se une opsina-->se forma rodopsina-->con la luz sale opsina-->se forma todo-trans retinal
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como se almacena vitamina A
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en hígado y tejido adiposo como quilomicrones que contienen esteres de retinol
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deficiencia de vitamina A
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ceguera nocturna=nictalopía
deficiencia intensa-xeroftalmia (resequedad de la cornea y conjuntiva) |
toxicidad de vitamina A
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hipervitaminosis A
-piel seca y pruritica -puede llevara hígado cirrotico -aumenta presión intracraneal |
conversion a quilomicrones
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b-caroteno-->retinal-->retinol-->esteres de retinilo-->quilomicrones (van de la linfa a la sangre)
retinol-->esteres de retinilo-->quilomicrones |
por que es diferente la vitamina D
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funciona como hormona porque se sintetiza en la piel, tiene receptores nucleares, aumenta la absorción de calcio
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formas activa de vit D
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1,25-diOH-D3
1,25-dihidroxicolecalciferol |
tipos de vitamina D
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D2 ergocalciferol- de plantas
D3 colecalciferol-de origen animal |
formation de 1,25-diOH-D3
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7-dehidrocolesterol es el precursor-->luz convierte a-->D3 colecalciferol--> 25-hidroxilasa hidroxila-->25-OH-D3-->1,25-diOH-D3
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como activa el aumento de calcio serico
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PTH hormona paratiroidea aumenta 1,25diOH-D3-->aumenta la movilización de calcio desde el hueso-->aumenta reabsorción renal de calcio-->disminuye excresion renal de calcio-->aumenta absorción de calcio desde el intestino
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deficiencia de vitamina D
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raquitismo y osteomalacia, por una dismineralizacion del hueso debido a una mineralizaron incompleta
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formas de encontrar vitamina K
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K1 filoquinona- en plantas
k2 menaquinona- en la flora intestinal |
function vitamina K
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actua como coenzima en la carboxilacion de ciertos residuos de acido glutamico en proteinas de la coagulación sanguinea
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papel de vitamina K en la coagulación sanguinea
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factores de coagulación requieren la carboxilacion dependiente de vitamina K que se oxida a su forma epoxido-->hace maduros los factores de coagulación (añadiendo COO-)--> forma residuos de Gea carboxiglutamilo
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inhibe la formación de residuos Gla
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warfarina
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que pasa después con los reisudos de Gla en sangre
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son buenos quebrantes de Ca=iones positivos (como pinzas para agarrar el Ca), debido a sus grupos carboxilato con carga negativa
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forma activa de vitamina E
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alfa-tocoferol
-son 8 tocoferoles naturales |
funciones de vitamina E
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efecto antioxidante para evitar la lipoperoxidacion,
mide peroxidacion de ácidos grasos in vitro -evita lipooxidacion (toma electrones para que lípidos no intoxiquen la membrana) |