Que es un gen	Secuencia de nucleótidos en el ADN que codifica un producto funcional (Proteína o ARN)
Para que un gen traduzca una proteína se tiene que llevar a cabo un proceso cual es	El ADN debe ser transcrito a ARN y este ARN es traducido a una proteína
Transcripción que es	proceso de generación de una copia de ARN a partir de una secuencia de ADN de un gen. Esta copia, llamada ARN mensajero (ARNm), es portadora de la información sobre la proteína que el gen tiene codificada en ADN.
DNA	Almacén de información
mRNA	mensajero de información
Proteínas	maquinaria célular activa
traducción que es , donde ocurre en eucariotas, y las mitocondrias?	el segundo proceso de la síntesis proteica que ocurre en todos los seres vivos. Se produce en el citoplasma, donde se encuentran los ribosomas. en la célula eucariota ocurre también en el retí**** endoplasmático rugoso, las mitocondrias tienen su propio proceso de traducción.
Dogma central de la biología celular	DNA---transcribe--->mRNA---traduce--->proteina
Tipos de ARN	ARNm ARNt ARNr
ARNm características son 5	expresión genética secuencia monocatenaria función de plantilla para el proceso de traducción (a proteínas) tiene codones en eucariotas se sintetiza como pre ARNm y se modifica (eliminación de intrones, colita poli a, caperuza)
Que son los codones	la secuencia de 3 nucleótidos (3 letras) y codifican para un aminoácido
Que es la caperuza	También se llama CAP5' Es un nucleótido alterado, y ubicado en el extremo 5' de algunos transcritos primarios en eucariotas como el precursor de ARNm
ARNt características son 6	Molecula que tiene el anticodon carga un aminoácido específico en el extremo 3' (OH) al menos 20 aminoácidos diferentes se pliegan para formar una estructura secundaria se modifica post transcripción (después) se dedica a hacer proteínas
Anticodon	complementario al codón lo que forma una estructura tridimensional como un trébol de forma que las regiones complementarias estén a la par
ARNr características 7	forma parte de los ribosomas cataliza la formación de enlaces Péptidicos diferente en procariotas y eucariotas papel importante en la lectura del ARNm y adaptando el ARNt hacen proteínas diferentes tienen sub unidad pequeña y sub unidad grande hay muchos pero duran poco tiempo
Ribosoma Procariotico unidades y sus proteínas	sub unidad pequeña 30s---> 21 proteínas sub unidad grande 50s--->34 proteínas Union de ambas 70s
Ribosoma eucariotico	sub unidad pequeña 40s --->33 proteínas sub unidad grande 60s ---> 45 proteínas Union de ambas unidades 80s
ARN no codificantes "pequeños" en eucariotas	-ARN nucleolares pequeños (snRNA) importantes en el procesamiento de ARNr y ARNm. -Micro ARN (miRNA) y silenciadores (siRNA) estos inhiben la expresión del gen. -ARN no codificantes largos (incRNA) son los menos conocidos se encargan de la modificación de cromatina y expresión de los genes.
ARN codificante de proteínas	ARNm son muy pocos van de inestable a muy estable.
Transcripción de ARN enzima	RNA polimerasa
Que hace la RNA polimerasa	Cataliza la polimerización de Ribónucleósidos 5'trifosfato (NTP) para un molde de ADN
En que dirección se realiza la transcripción y requiere algo	De 5' a 3' no requiere un cebador
Como empieza	Empieza de novo (nuevo o 0)
ARN pol procariota características (son 3)	4 tipos distintos de sub unidades alfa(1), beta(1), beta' (1), Omega(este parece una w y 1) estas forman el núcleo. alfa determina el funcionamiento de la polimerasa y se puede unir a proteínas específicas para su regulación. La subunidad cigma parece un círculo con una línea hacia la derecha arriba se encuentra unida de forma relativamente débil y puede separarse, es esencial para la correcta localización ya que reconoce el promotor pero no es necesaria para la función catalítica de la enzima.
Características de la transcripción (10)	No se transcribe todo el ADN solo un 80% aproximadamente. ADN cadena molde (la que se transcribe) ↑ Son iguales ↓ ARN cadena codificante solo se cambia la T por la U. (misma secuencia de codones que el ARNm :) No hay helicasa. Se inicia en secuencias promotoras. No se necesita un primer preformado. Es selectiva. Los Ribonucleótidos se une por enlace fosfoester de 5' a 3'. Es selectiva por que la polimerasa sabe cual es la molde.
Pasos de la transcripción de RNA	1-Unión a plantilla y formación del complejo cerrado. 2-Formación del complejo abierto. 3-Inicio de la cadena. 4-Eliminación del promotor. 5-Alargamiento de cadena. 6-Terminación de la cadena y liberación de RNAP (Aquí se termina por que no se transcribe todo el gen DNA)
Promotor (transcripción de ARN) en procariotas	Es la secuencia de ADN a la que se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripción de un gen a esto se le denomina promotor. Sitio de inicio de la transcripción+1 (TSS) Hacia menos esta corriente arriba y se encuentra el promotor. región -10 Aquí esta TATA región -35 La secuencia hacia + es corriente abajo esta la región transcrita. entre las secuencias -10 y -35 se le llama secuencia de consenso o caja pribnow esta regula que el gen se encienda o apague.
Inició en procariotas (transcripción ARN) su proceso. nombre del conjunto y los pasos.	El conjunto formado inicialmente entre la polimerasa y el promotor se llama complejo promotor cerrado por qué el DNA no se encuentra desarrollado. 1- DNA Unido a la polimerasa de forma no especifica. 2- Unión específica de cigma a las secuencias promotoras -35 y -10. 3- Complejo promotor cerrado. 4- Separación de las cadenas de DNA alrededor del sitio de iniciación. 5- Complejo promotor abierto. (Ruptura de los puentes de hidrógeno y lo abre la misma polimerasa [desenrrolla entre 12-14 bases de DNA al rededor del sitio de inicio para dar un complejo promotor abierto y da la hembra única molde de ADN para la transcripción] al inicio va lento ya que no está bien pegada y luego va rápido) 6- Iniciación de la transcripción.
Elongación o Alargamiento en procariotas y los últimos pasos	7- Liberación de cigma 8-Elongación de la cadena de RNA Tras la traducción de unos 10 nucleótidos la subunidad cigma se separa de la polimerasa que abandona la secuencia promotora. progresa sobre el molde de DNA para continuar con el enlogamiento de RNA. Las Subunidades B y B' (un canal interno entre estas acomoda unas 20 pares de bases de DNA y contiene el centro activo de la polimerasa)forma una estructura en forma pinza de cangrejo que sujeta el molde de ADN y forma un canal catalítico de elongación.
ARN polimerasa procesividad	La procesividad de esta es el número de nucleótidos añadidos a la cadena de ADN que sintetiza , la polimerasa sin llegar a ser separado de la cadena molde (capacidad de avanzar en el molde DNA).
Tipos de terminación en procariotas hay 2 tipos	Rho dependiente (Proteína que se pega al terminador gasta ATP). Rho independiente (Por secuencias palindromicas).
E. coli consiste en	Una secuencia palindromica (que se lee igual al derecho y al reves Además de ser complementarias) Rica en C-G
Transcripción eucariota	diferencias
Diferencias transcripción características en procariotas	-El proceso es más simple. -El RNA transcrito primario es funciona (no precisa maduración post transcripcional). -El RNAm se empieza a traducir según se va transcribiendo. -Interviene un solo tipo de RNApol. -El RNAm es polisincrónico (codifica para varias cadenas polipéptidicas). -La señal de terminación es una secuencia palindromica.
Diferencias trascripción eucariota	-Proceso más complejo. -El RNA primario sufre en el núcleo el proceso de maduración o procesamiento post transcripcional. -Los RNAm deben ser enviados al citoplasma para ser traducidos. -Intervienen 3 tipos de RNA Pol (I, II, III). -El RNA es monosincronico (codifica para una sola cadena polipéptidica. -La secuencia de terminación suele ser TTATT.
Promotores en eucariotas	-Son más grandes. -Múltiples promotores. -La mayoría esta corriente abajo. -Están regulados pueden estar muy encendidos, masomenos encendidos o poco encendidos. -Expresión regulada. ↓ -Elementos reguladores distales. -Otros elementos reguladores. -Elemento aumentador (+) y represor (-). -La expresión basal manda si esta encendido. ↓ -Elementos proximales motores GC- CAAT corriente abajo. -Promotor más conocido en -1 TATA esta corriente arriba. -El +1 se encuentra en el sitio de inició y es INR. -En +2? se encuentra corriente arriba DPE.
RNA Pol (dependientes de DNA nucleolar de mamíferos) eucariota y sus 3 tipos (sensibilidad a la alfa amanitina) y sus productos importantes	I - Insensible y rRNA. II - Sensibilidad alta mRNA, miRNA, snRNA. *** más importante. III - Sensibilidad intermedia, tRNA, rRNA 5s.
RNA II	TFII (A-B-D-F-H) Transcriptores TFIIE Transcribe mRNA Todos los anteriores se encuentran Unidos a la RNA Pol II
Que es TAF	factores accesorios
Que es TBP	Proteína de Unión a TATA
Primer paso en la formación de un complejo de transcripción	Consiste en la Unión de un factor general de transcripción denominado TFIID al promotor (Lo reconoce) D va con TAF
TIFII se compone de	varias subunidades como la Unión de la proteína TATA (TBP) y otros 14 polipéptidos que son denominados factores asociados a TBP (TAF) reconocen Inr, DPE, DPC y MTE.
La Unión de TFIID se sigue del	reclutamiento de un segundo factor general de transcripción TFIIB que se une a TBP.
TFIIB actúa como	Puente para la RNA polimerasa que se une al complejo TBP-TFIIB junto a un tercer factor TFIIF.
En el proceso se unen 2 factores adicionales	TFIID Y TFIIH (2 funciones y la H es por helicasa que abren el DNA.
TFIIH es	las helicasas rompen puentes de hidrógeno para formar el complejo. también es necesario para la escisión y reparación de nucleótidos. La H fosforila la colita poli A debe tener fosfatos tiene dominios carboxilo terminal
otra sub unidad de la TFIIH es...	Es una proteína quinasa que fosforila determinadas secuencias repetidas en el dominio C Terminal de la subunidad principal de la RNA polimerasa II. Induce la liberación de la polimerasa del complejo de pre iniciación y da lugar al comienzo de la transcripción.
otra sub unidad de la TFIIH es...	Es una proteína quinasa que fosforila determinadas secuencias repetidas en el dominio C Terminal de la subunidad principal de la RNA polimerasa II. Induce la liberación de la polimerasa del complejo de pre iniciación y da lugar al comienzo de la transcripción.
Unión del mediador que hace	no sólo estimula la transcripción basal si no que además desempeña una función clava en la asociación de los factores generales de transcripción con los factores específicos de transcripción.
El CDT fósforilado	se une a otras proteínas que facilitan la elongación transcripcional y que participan en el procesamiento de mRNA
Hay 2 teorías	Aunentador-TATA-ORF (lo que se va a copiar) + Pol II, GTF, mediador las 2 teorías A) Por pasos uniéndose todo poco a poco. B) Por la holoenzima y todo se pega por obra de magia y ya sin tanto proceso.
Deben haber terminadores	y se encargan de apagar del proceso luego de la elongación.
Maduración del mRNA	El primer paso es la modificación del extremo 5' mediante la adición de una nueva estructura denominada caperuza (cap5') o cap de 7 metilguanosina para este proceso se requiere GTP.
Proceso de maduración	Deben haber 3 fosfatos. DNA Intron se debe cortar con esto así no debe salir del núcleo y no nos sirve. ↓ transcripción. mRNA primario ↓ punto de Corte 5' m7G funciona a que las exonucleasas no corten el DNA y ayuda a que salga. ↓ poliadenilación en 3' (lo hace la Poliadenilasa y se encarga de poner cientos de adeninas) m7G ya con la colita poli A(ayuda a salir y que se pegue al ribosoma. ↓ Empalme Quita los intrones pegando los exones mRNA maduro
De que se encarga la CAP en 5'	Estabiliza el RNA además de alinear los mRNA Eucarioticos sobre el ribosoma durante la traducción.
Que sucede en el extremo 3' de los eucariotas	se suele modificar con la adición de una colita poli A una señal de poliadenilación es el hexanucleotido AAUAAA
Codón de inició en	la región no traducida 5'
codón de terminación	extremo 3' no traducido
función de la colita poli A	regula la traducción y estabilidad del mRNA
Que es el splicing	Corte y empalme
Que son los exones	Secuencias de RNA que se traducirán
Que son los intrones	Secuencias de RNA que no se traduciran
Los intrones donde quedan y que pasa con ellos	En el núcleo y se reutilizan
Exón	Llegan afuera del núcleo
Proceso de Corte y empalme	En la molécula precursor de mRNA esta ->5' exón (secuencia especial) ---intron--- 3' exón (secuencia especial). luego Se suelta el 5'exon quedando plegado el intron. después ambos exones se van acercando hasta soltar el intron. el intron queda Suelto en el núcleo esperando ser reutilizado. al estar Unidos los exones ya se encuentra el mRNA maduro.
Importancia clínica de la transcripción	Dependiendo del intron que se quita se pueden hacer diferentes proteínas parecidas que se expresan en distintos lugares y tiene diferentes funciones uso de promotor alternativo en genes para glucoquinasa en células del hígado y beta pancreáticas. errores en el Corte y empalme puede asociarse a enfermedades

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