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¿ Qué es química farmacéutica?
¿ Qué es química farmacéutica?
Ciencia que trata el descubrimiento y diseño de nuevos agentes químicos terapéuticos y su desarrollo en medicamentos útiles.
¿ Qué es fármaco o principio activo?
¿ Qué es fármaco o principio activo?
Sustancia pura, químicamente definida, extraída de fuentes naturales o sintetizada, dotada de una acción biológica, que puede o no ser aprovechada por sus efectos terapéuticos.


*La acción biológica puede ser benéfica o dañina.
¿Qué es droga?
¿Qué es droga?
Definición en España:

Materia prima de origen natural, dotada de actividad biológica que contiene 1 o varios principios activos que no han sufrido manipulación, salvo para su conservación.

Carmen Avendaño

*Sustancia que se presenta para tratamiento, cura o prevención de alguna enfermedad.
¿Qué es medicamento?
¿Qué es medicamento?
Forma farmacéutica que contiene el o los principios activos.
SAR ó REA
SAR ó REA
Structure Activity Relation (inglés)

Relación Estructura-Actividad (español)
Activity cliff
Activity cliff
Compuestos estructuralmente PARECIDOS pero con acción DIFERENTE.
Activity switch
Activity switch
Compuestos estructuralmente PARECIDOS pero con acción OPUESTA.
Scaffold hop
Scaffold hop
Compuestos estructuralmente DIFERENTES con la MISMA acción.
Clasificación de fármacos
Clasificación de fármacos
1. Efecto farmacológico.

2. Mecanismo de acción (MOA).

3. Asociación estructura-efecto.
Nomenclatura de fármacos
Nomenclatura de fármacos
1. SIN propietario
° Nombre químico sistemático (por estructura)
° Denominación común (por efecto)

2. CON propietario
° Código del fabricante
° Nombre comercial/registrado
3 etapas en la acción de un P.A.
3 etapas en la acción de un P.A.
1. Fase farmacéutica

2. Farmacocinética
° ADME

3. Farmacodinámia
° Interacción F-R
° genera efecto
Etapas del desarrollo de fármacos
Etapas del desarrollo de fármacos
Descubrimiento
° Investigación básica
° Selección del target
° Compuesto c/ señales de actividad biológica ------ HIT

Optimización
° Compuesto LEAD
° Mejorar la sustancia
Selectividad
Toxicidad
Potencia

Desarrollo
° Fase pre-clínica
Reposicionamiento de fármacos
Reposicionamiento de fármacos
Fármaco que ya está aprobado para alguna actividad farmacológica, pero se vuelve a aprobar para otro tratamiento diferente (polifarmacología).
Código ATC
Código ATC
Clasificación Anatómica- Terapéutica- Química asignado por el Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology de la OMS.
Reglas de Lipinski
Reglas de Lipinski
1. No debe contener más de cinco donadores de enlaces por puentes de hidrógeno (átomos de nitrógeno u oxígeno con al menos un átomo de hidrógeno).

2. No debe contener más de diez aceptores de enlaces por puentes de hidrógeno (átomos de nitrógeno, oxígeno o flúor).

3. Debe poseer un peso molecular inferior a 500 uma.

4. Debe poseer un coeficiente de reparto octanol-agua (log P) inferior a 5.
Reglas de Veber
Reglas de Veber
1. Enlaces rotables menores de 12.

2. Área superficie polar menor de 140.
Polifarmacología
Polifarmacología
Fármaco que ya se encuentra aprobado para alguna actividad farmacológica y se re-aprueba para ahora, otro tratamiento.
Métodos tradicionales  del origen de los principios activos
Métodos tradicionales del origen de los principios activos
1. Síntesis Química

2. Productos Naturales

3. Microorganismos
Código SMILES
Código SMILES
Simplified Molecular Input Line Entry Specification
(Especificación linear molecular simplificada)

Especificación para describir la estructura de una molécula.
Código InChi
Código InChi
International Chemical Identifier
(Identificador de sustancias químicas)

Diseñado para proporcionar una forma estándar y legible de codificar la información molecular para facilitar la búsqueda de información en bases de datos.
Prontosil
Prontosil
Primero utilizado como colorante para tinción de bacterias. Después encontraron que este es metalizado a sulfonamida el cual tiene acción antibacteriana.
HTS 
High-throughput screening

(Ensayos de alto rendimiento)
HTS
High-throughput screening

(Ensayos de alto rendimiento)
Método que permite realizar hasta millones de pruebas biológicas, bioquímicas, genéticas o farmacológicas utilizando programas específicos, procesamiento de datos, software de control, manejo de líquidos y detectores.
Microtitre plate

(Platos de ensayo)
Microtitre plate

(Platos de ensayo)
Contenedor de plástico el cual contiene pequeños pozos con compuestos de prueba dentro de estos, utilizado para ensayos HTS.
Pasos de una prueba HTS
Pasos de una prueba HTS
1. Etapas principales (Primera ronda de ensayos)
Se coloca el compuesto a una sola concentración elevada.

2. Segunda ronda de ensayos (Confirmatoria)
Se realizan ensayos dosis-respuesta
"Cherry picking"
"Cherry picking"
Selección manual de los compuestos aprobados.
Compuestos Hits
Compuestos Hits
Compuestos que en la primera etapa de descubrimiento de un fármaco, utilizando una dosis, se ha encontrado que este posee una actividad.
Compuestos Hits validados
Compuestos Hits validados
Compuestos que en un ensayo secundario se confirma que el compuesto tiene una actividad biológica haciendo uso de curvas dosis-respuesta.
Compuestos Lead
Compuestos Lead
También llamados modelos o prototipos, son compuestos que después de ser validados pasan a un proceso de optimización de las propiedades ADME.
Para evitar falsos positivos
Para evitar falsos positivos
Preguntarse:

Pureza e identidad.
PAINS
"Pan Assay Interference Compounds"
PAINS
"Pan Assay Interference Compounds"
Compuestos que aparentan ser activos.
Química Combinatoria
Química Combinatoria
Método de síntesis en fase sólida que genera grandes colecciones de compuestos en poco tiempo.
Linker
Linker
Grupo funcional que sirve como puente.
Cleavage
Cleavage
Denominado así al producto de una resina.
Ventajas de la química combinatoria
Ventajas de la química combinatoria
1. Se puede automatizar.
2. No hay necesidad de aislar y purificar los intermediarios.
3. Un exceso de reactivos puede enjuagarse con los disolventes adecuados.
Colecciones de compuestos para HTS
Colecciones de compuestos para HTS
1. Compuestos comerciales de síntesis.

2. Productos naturales.

3. Colecciones in-house (privadas).
Objetivo de las Modificaciones
Objetivo de las Modificaciones
• Optimizar la actividad farmacológica principal
• Disponer de fármacos más selectivos y menos tóxicos
• Mejorar la farmacocinética
• Disminuir (eliminar) problemas de formulación
farmacéutica asociados con solubilidad y/o
estabilidad inadecuados
• Novedad / Propiedad intelectual (IP)
Tipos de Modificaciones Moleculares
Tipos de Modificaciones Moleculares
• Simplificación del prototipo
• Asociación de moléculas: moléculas híbridas
• Modificaciones sistemáticas
Modificaciones sistemáticas

1. Homología
Modificaciones sistemáticas

1. Homología
Adición o sustracción de un carbono a una cadena o anillo en donde la lipofília de la molécula homóloga puede aumentar o disminuir.
Modificaciones sistemáticas

2. Ramificaciones de Cadena
Modificaciones sistemáticas

2. Ramificaciones de Cadena
• Disminuyen la lipofilicidad debido a que la molécula va perdiendo los enlaces de Van der Waals.

• Se puede añadir grupo metilo.
Modificaciones sistemáticas

3. Introducción de Grupos Aromáticos
Modificaciones sistemáticas

3. Introducción de Grupos Aromáticos
Estos pueden incrementar las interacciones con la diana terapéutica y de igual manera disminuyen la solubilidad acuosa del compuesto.
Modificaciones sistemáticas

4. Apertura o Cierre de Anillos
Modificaciones sistemáticas

4. Apertura o Cierre de Anillos
Estrategia para buscar la conformación que se une con la diana terapéutica en donde ocurren cambios conformacionales bioactivos.
Modificaciones sistemáticas

5. Introducción de Enlaces Múltiples
Modificaciones sistemáticas

5. Introducción de Enlaces Múltiples
Ya sean enlaces dobles o triples con los que aumenta la rigidez molecular y se altera la geometría del compuesto.
Modificaciones sistemáticas

6. Principio de Vinilogía
Modificaciones sistemáticas

6. Principio de Vinilogía
Se define como dos sustituyentes X, Y unidos por una cadena vinilénica que se comportan como si estuvieran unidos directamente y que mantiene la actividad gracias ala conjugación de los electrones.
Isósteros
Isósteros
Son átomos o grupos de átomos que tienen la
misma valencia y que tienen propiedades físicas o químicas similares.

• Isosterismo clásico

• Isosterismo no clásico
Bioisósteros
Bioisósteros
Término empleado en diseño de fármacos que implica un grupo que puede cambiar a otro manteniendo la
actividad biológica deseada.