Tipos de plásmidos	Virulencia y resistencia Gpos de imcompatibilidad Conjugación y no conjugativos Adquisición ADN plasmático Fertilidad
Bacterias que giran positivo	Archea hipertermofilus Methanococcus fervidus
Que es una mella	Lugar donde se traslapa el ADN bacteriano. Esto aporta resistencia a la desnaturalización
Bacterias que pueden degradar antibioticos	Salmonella typhi Neisseria Meningitidis Neisseria Gonorrhoae
Mutación con sentido erróneo	Cambio de un par de bases se da la sustitución de un Aa. en la proteína
Mutación sin sentido	Codon de terminación prematuro. Se da en ARN
Mutaciones en RNA	Principalmente en virus 100x mayor que en ADN No existen métodos de reparación de ARN
Mutágenos químicos	Análogos a bases Alquilantes Intercambiables
Mutagenos Análogos a bases	Se unen a bases N pero no exhiben correctas propiedades de plegamiento
mutagenos Alquilante	Ataca el ADN cuando no se está replicando. Inducen mutaciones con mayor frecuencia
Transformación	ADN donador se encuentra en estado libre en ambiente
Transducción	Transferencia de ADN mediada por un virus
Conjugación	Implica contacto célula-célula, presencia de plásmido conjugativo de la célula donadora
Que es que una célula sea competente para intercambio genético	Que sea capaz de tomar ADN y ser transformada. Es determinada genéticamente y regulada. Proteínas específicas (Autolisina y nucleasas)
Transformación génica	ADN se incormpora a la célula y lleva a cambio un cabo genético, se da a cabo por recombinación o entrecruzamiento
Características para que se de la tranformación génica	Pared celular intacta ADN donador debe ser doble cadena Basta la interacción de una sola molécula de ADN con la receptora ADN entrante debe recombinarse para transmitir características Célula debe ser competente
Incorporación en transformación génica	ADN entra monocaternario Gram -: ADN se degrada en el periplasma y penetra el cito en forma de cadena sencilla Gram +: Sólo toman un lado de la cadena mientras degradan el otro simultáneamente
Integración en transformación génica	ADN se asocia con proteína específica para no ser degradada hasta que es sustituida por RecA Se integra por recombinación
Quarum Sensing	Sistema de comunicación que conforman una matriz que les confiere mayor resistencia por biopelículas.
Que es una biopelícula.	Comunidades microbianas con gran capacidad de adherencia a una superficie donde se produce una matriz de exopolisacáridos
Biopelículas usadas en procesos de biorremediación y tratamiento de aguas residuales	Agrobacterium tumefacien Erwina carotovora Pantoea stweartii Ralstonia solanacearum Pseudomonas aureofaciens
caracterísitcas transducción génica	Gen bacteriano transferido por virus Es error en empaquetamiento del genoma viral
Ciclo lítico	Fijación Inyección material genético Degrada el cromosoma bacteriano Replicación genoma vírico Sintetizar cuerpos víricos proteícos Empaquetación de ADN en cuerpo vírico Lisis de la bacteria, liberación de bacteriofágos
Ciclo lisogénico	Fijación a pared Inyección del material Recmbina ADN con el ADN del cromosoma bacteriano Replica el ADN junto con el bacetriano cuando hace mitosis ADN vírico se escinde del cromosoma Se lleva a cabo ciclo lítico
Transducción generalizada	Debido a error se empaqueta una porción de ADN bacteriano en cuerpo vírico en lugar de el del bacteriofago No hay especificidad Se puede integrar (transferencia completa) Degradar (se lisa) o sobrevivir (nomás está ahí alv)
Transducción específica	El ADN bacteriano cerca de la zona de integración es el que se va durante la escisión con el viral
Conversión fágica	Bacteriofago lisogeniza una célula es unmune a una nueva infección por el mismo tipo. Corynobacteruim diphteriae no produce toxinas en cepas productoras de toxinas
Conjugación.	Mecanismo de transferencia genética que implica contacto entre células. Mediado por plásmido, (Célula que lo tiene y célula receptora que no lo tiene) Descubierto por plásmido F de E. coli
Plásmido F	F de fertilidad, Kapon. Región del plásmido contiene genes que regulan la replicación del ADN. Elementos transponibles permiten al plásmido integrarse en el cromosoma del hospedador. Región tra contieen genes que codifican las funciones de transferencia.
Plásmido F: El imperio contraataca	Origen de replicación: Ori Sitio de inicio: OriT Sólo células con este plásmido producen pilis. Congujación de Gram - depende del apareamiento de las células a través de los pelos (a lo avatar we)
Mecanismo de transferencia del ADN: Circulo rodante (olv)	ADN del plásmido F se replica por circulo rodante (usado también por virus)- 1: Contacto desencadena la transferencia de ADN. En el momento que una cadena del ADN circular es cortada y transferida al receptor.
Enzima que corta en Transferencia del circulo rodante	TraI, que también la desenrrolla
Circulo rodante parte 2	A medida que se prodduce la transferencia, el mecanismo reemplaza la cadena transferida en el donador mientras se sintetiza una cadena complementaria. Al final los dos tienen el plásmido completo Se tarda 5 min (100 kbp)
Cómo se pueden perder los plásmidos en transferencia de circulo rodante	Por curación, no hay presión selectiva para mantener el plásmido
Que es un episoma	Plásmido que se puede integrar en el cromosoma del hospedador. Ya integrado, pueden transferir genes cromosómicos
Células F+	Células que poseen el plásmido F no integrado
Células Hfr	Plasmido integrado en el cromosomas. Conjugación lleva a la transferencia de genes del cromosoma del hospedador. (Cromosoma + plásmido son uno mismo, uhoh).
Que provoca la presencia del plásmido F	Sintetizan pilis Movilizan ADN para transferencia a otra célula Alteración en los receptores superficailes, la célula deja de ser receptor en conjugación.
Que es la complementación	Gen silvestre complementa una mutación defectiva, corrigiendo el problema
Trasposones	Son secuencias de ADN que pueden moverse de manera autosuficiente a diferentes partes del genoma de la célula. Aparecen en cromosoma principal y plásmidos bacterianos. Se transponen entre cromosoma y plásmido Presentes en euca y proca Siempre integrados (qué envidia) No presentan homología con la secuencia donde se van a integrar, causando mutaciones.
Transposones tipo 1 simples	700-2000 pb Contiene gen TnpA que codifica la transposasa Flanqueado por dos secuencias invertidas repetidas cortas (15-25 pb)
Transposones tipo 1 compuestos	Un gen (usualmente resistencia a antibiótico) está flanqueado por dos sec. de inserción.
Transposones tipo 2	Contiene al menos 3 genes TnpA (transposasa) TnpR (resolvasa) Gen que da resistencia a antibioticos Flanqueado por secuencias repetitivas invertidas
Transposones tipo 3	Fagos que, en lugar de insertarse en el genoma por recombinación, lo hacen por transposición
Secuencias de inserción	Segmentos de ADN bacteriano que pueden moverse de posición en el mismo cromosoma o distinto. Cuando aparecen en medio de los genes, interrumplen la secuencia de codificación e inactivan expresión del gen
Estructura S.I.	Repeticiones invertidas en los extremos-Región codificante central: Transposasa. Extremos flanqueads por cortas repeticiones directas (5-11 pb) Secuencia variable en sitio de inserción
Características S.I.	>20 tipos distintos mov. poco frecuente pueden inactivar genes Pueden transferirse a otras bacterias mediante transposición a plásmidos o virus
Mecanismo Transposones	Corta el elemento (extremo romo) Corta el ADN en sitio de integración (extremo protuberantes) Liga el elemento en el nuevo sitio (3' del SI al 5' del ADN aceptor) Rellena y cierra Nick: ADN polimerasa y ligasa de bacteria
Transposasa	Proteína específica que introduce el transposón a una secuencia.
Diferencia transposones con recombinación	no requiere homología entre secuencia donadora y aceptora
Donde fueron descubiertas las SI	E. coli en operador gal Transposones más simples (700-1500 pb en eubacterias y arqueobacterias) Frecuentes en bacteriófagos y plásmidos

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