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17 Cartas en este set
- Frente
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- 3er lado (pista)
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secuencias up
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secuencias de reconocimiento más alejadas del sitio de iniciación
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Mutaciones ascendentes
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Aquellas que incrementan la fuerza del promotor. Se asemejan más a la secuencia consenso. Resultado: promotor fuerte
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Mutaciones descendentes
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Aquellas cuyo resultado es un descendimiento de la fuerza del promotor. Menos similitud a secuencias consenso. Resultado: promotor débil
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¿Cómo se puede variar la fuerza del promotor? Factores
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-Proteínas reguladoras (activadores)
-Topología del DNA |
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Ejemplos de promotor fuerte y promotor débil
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Promotor débil: lactosa (región -10 y -35 varía y por ello se une menos frecuentemente la RNApol)
Promotor fuerte: Sigma 70 |
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¿Qué es la enzima núcleo de la RNApol de E.Coli?
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conjunto de subunidades sin la subunidad sigma
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Estructura RNApol de E.Coli
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-Holoenzima: dos alfa, dos beta, un sigma y un Omega.
-Enzima núcleo -Favorable al obtenerse 2Pi a partir de 2PP -In vivo necesita Mg+ e in vitro Zn+ |
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Funciones RNApol de E.Coli
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-Reconoce sitio iniciación
-Desenrrolla las dos hebras de DNA -Sintetiza el RNA -No requiere iniciador -Actividad correctora: puede tenerla o puede ser ayudada a que se describa -Abre y enrolla la zona transcrita -intetacciona con proteínas reguladoras -Selecciona el NTP correcto -Reconoce sitio de terminacion |
Son 9
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Actividades de la RNApol. Diferencia de actividad entre Holoenzima y enzima núcleo
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*En forma activa es la holoenzima y forma inactiva es la enzima núcleo
Se observó que la holoenzima al transcribir si sintetizaba RNA. Sin embargo la enzima núcleo no era capaz de reconocer el sitio de iniciación. Al carecer esta de la sub sigma se atribuye a esta subunidad el reconocimiento del sitio de iniciación. |
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Subunidad Omega de RNApol de E.Coli. Implicaciones estructurales
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-Mantener plegamiento y protección de B'
-recluta factor sigma -Ensamblaje RNApol |
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Implicaciones funcionales subunidad Omega RNApol de E.Coli
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-Adaptación a condiciones de estrés
-Regula transcripción interaccionando con activadores transcripcionales -Implicado en supervivencia en fase estacionaria del crecimiento bacteriano -Conservacion -Meditar respuesta estricta (Condiciones de estrés) |
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Orden de ensamblaje del complejo RNApol de E.Coli
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1- dos subunidades alfa interaccionan formando un dimero
2- este dimerointerscciona con la subunidad beta. A la vez la subunidad beta' interacciona con Omega formando otro complejo 3- interaccionan los dos complejos= enzima núcleo 4- se une la subunidad sigma |
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Ordena: unidad de transcripcion; promotor; región activadora
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Región activadora-promotor-unidad de transcripción
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¿Qué subunidades de la RNApol de E.Coli se encargan de interaccionar con activadores?
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Las subunidades alfa interaccionan con la región activadora y la Omega queda próxima a esta siendo accesible a activadores transcripcionales
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Interacción con DNA
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En iniciación ocupa 75-80pb
Canal de DNA (16pb) pero en transcripción ocupa 50-60pb. No solo hay DNA en el canal si no que interacciona con otras regiones/subunidades |
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Diferencias RNApol T7 y la de E.Coli
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T7: no se une a activadores y solo es una cadena polipeptídica
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Funciones de NusA
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Impide la asociación de subunidad sigma al promotor al unirse ella al promotor.
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