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80 Cartas en este set
- Frente
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Gen
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Unidad funcional de la herencia
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Partes del gen
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Promotores, exones e intrones
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Genoma
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Carga genética total de un organismo
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Longitud del genoma humano
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3x10^9 pares de bases
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Secuencias codificantes del genoma humano
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25 mil
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Promotor
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-Secuencia de nucleótidos que marca el inicio de la transcripción.
-Alberga secuencias consenso. -Al final tiene una secuencia terminadora. |
¿Qué es el RNA?
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Molécula molde que permite que se generen los polímeros de aminoácidos. Requiere codones para ser leída.
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Factores de transcripción
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-Identifican secuencias promotor.
-Transportan motivos de unión que les permiten unirse al promotor junto con o después de la RNA polimerasa par activarla químicamente. |
Marco de lectuta abierto
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Secuencia codificante.
Contiene todos los codones que van a ser traducidos. |
Secuencias consenso
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-Secuencias altamente conservadas.
-Su tasa mutacional es muy baja. -Están presentes en todas las secuencias promotor. |
Motivos de unión
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-Dedos de zinc
-Cierres de leucinas -Residuos aminoacidicos que tienen la capacidad de reconocer secuencias nucleotídicas de las secuencias blancos. |
Exón
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Secuencia codificante
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Intron
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-Secuencias no codificantes.
-Más largas que los exones. -Reciben las mutaciones. |
hnRNA
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Es la primera síntesis del RNA.
Contiene intrones. Todavía no está maduro. Heterogéneo nuclear |
Alelo
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Forma alternativa de un gen
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Genotipo
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Conjunto de alelos que conforman el genoma de un organismo
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Haplotipo
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Firma génica. Conjunto de SNP's.
Caracterización de múltiples SNP's |
Enhancer
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Secuencia que activa el promotor
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Gen constitutivo
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Es un gen que tiene funciones críticas y es resistente a cambios.
Se expresa de manera constante. |
Ejemplos de gen constitutivo
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Actina---> Citoesqueleto
Beta-globina---> Transporte de oxígeno |
Función del RER
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Pliega las proteínas hasta su cuarta estructura.
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Con base a qué parámetros se estipula la dirección 5' a 3'
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La ubicación del grupo fosfato (5') y el grupo OH (3')
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¿Cómo son las secuencias de exones e intrones tanto en el DNA como en el RNA post-transcripcional?
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Alternadas una tras otra
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¿A dónde se ancla la RNA polimerasa?
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Al promotor
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¿Qué es una secuencia consenso, dónde se encuentran? Da un ejemplo
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Secuencias con una baja tasa de mutabilidad, se encuentran en el promotor y un ejemplo es la caja TATA.
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¿Cómo ocurre la traducción?
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Los ribosomas atraen a los aminoácidos presentes en el citoplasma. Los nucleótidos no se transforman en aminoácidos.
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¿Qué es un factor epigenético?
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Modificación genética no asociada a un ácido nucleico
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Ejemplo de modificación epigenética
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Metilación del promotor en las islas CpG. La citosina aledaña a la guanina es la que se metila.
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¿Qué provoca la metilación?
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Disminución en las copias transcritas o incluso una silenciación completa, pues la presencia de los grupos metilo dificulta el anclaje de la RNA polimerasa al promotor, ocasionando que no se transcriba o lo haga parcialmente.
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¿Qué significa CpG?
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Secuencia tándem de Citosina-Guanina
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Ejemplo de modificación poste traducción al que pueden sufrir las proteínas
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Fosforilaciones
Acetilaciones Metilaciones Glicosilación |
¿Qué es un marco de lectura abierta y cuáles son sus siglas?
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Son secuencias codificantes (alberga codones que pueden ser leídos por el ribosoma) y sus siglas son ORF.
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¿El tRNA tiene ORF?
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Nel
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Purinas
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Adenina y guanina (AG)
Dos anillos |
Pirimidinas
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Citosina, Timina, Uracilo
Un solo anillo |
Nucleósido
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Pentosa y base nitrogenada.
NO tiene grupo fosfato |
¿Por qué el DNA se llama "desoxi"?
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Porque le falta un grupo OH
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¿Por qué el DNA es más favorable para perpetuar la información genética?
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Porque la ausencia del OH en el carbono 2 de la pentosa lo vuelve menos reactivo
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¿Qué le hace el grupo OH al RNA?
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Lo vuelve más inestable y más reactivo
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¿Qué protección tiene el RNA y para qué?
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Ribonucleoproteínas para que sea más estable y pueda pasar del núcleo al citoplasma.
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¿Cuántos puentes de hidrógeno se forman entre A y T y qué significa?
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2, significa que es más espontáneo que ocurran rupturas entre los puentes. Hay un desequilibrio estequiométrico.
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¿Cuántos puentes de hidrógeno se forman entre C y G y qué significa?
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3, es más estable pues necesitan más energía para romperse
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¿Qué dirección tiene la cadena codificante y qué significa?
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5' a 3', tiene lectura abierta
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¿Cómo se llama la cadena contraria a la codificante y qué dirección tiene?
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3' a 5', es la cadena opuesta o molde
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¿Qué dirección tiene la cadena de RNA?
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5' a 3'
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¿Qué es un enlace fosfodiéster?
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Enlace entre grupo fosfato y pentosa. Enlace entre A y G
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¿Cómo inicia y cómo termina la cadena de ADN y para qué sirve?
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Inicia con un grupo fosfato en el C5 de la primera pentosa y termina con un grupo OH en el C3, permite distinguir la dirección de la cadena codificante.
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¿Qué es un enlace N-glucosídico?
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Un enlace entre pentosa y base nitrogenada
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¿Cómo se da la secuenciación y alineamiento génico?
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Se da mediante la complementariedad de bases y reconociendo la cadena codificante.
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Forma B del DNA
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-De 10 a 11 nucleótidos por giro
-Dextrógiro -Alta concentración de A y G -Modelo propuesto por Watson y Crick |
Surco mayor
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-Se insertan los cofactores enzimáticos.
-22 A |
Surco menor
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-Se unen cofactores de los factores transcripcionales, por ejemplo, enzimas auxiliares como las helicasas o topoisomerasa.
-12A |
A-ADN
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-Superenrollado
-Dextrógiro -Forma helicoidal -11 pb por giro |
Z-ADN
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-Forma de Zigzag
-Hebras paralelas pero no forman una hélice. -Levógiro -12 pb por giro |
¿Cuándo aparece la forma A del ADN?
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Es característica bajo la presencia de SNP, aunque depende del contexto enzimático en el que se encuentre, no solo de la concentración salina. La topoisomerasa caracteriza la presencia de esta forma.
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¿Cuáles son las enzimas que se encargan del relajamiento del genoma?
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Helicasas, topoisomerasa, girasa
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Apoptosis
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Muerte celular programada.
Ocurre si un fragmento de DNA dañado es muy grande o afecta a una proteína muy importante. |
¿Dónde se anclan los factores transcripcionales?
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Depende del blanco genómico. Son muy grandes respecto a los surcos por lo que pueden unirse a ambos al mismo tiempo.
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Nucleótido
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Base nitrogenada + pentosa + grupo fosfato
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DNA de E.Coli
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4x10^6 pares de bases
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UTR
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Regiones no traducibles.
Le dan estabilidad al RNAm. Son secuencias consenso |
UTR 5'
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-350 pares de bases
-Sirve como sitio de unión a los ribosomas. |
UTR 3'
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-Da la señal para iniciar la traducción uniéndose brevemente al complejo ribosomal, después se desdobla.
-250 pares de bases |
Ejemplos secuencias consenso
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-Caja TATA en -10
-Caja TTGACA en -35 -CBPbeta al rededor de -200 |
Enhancer cis
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-Secuencias en o aledañas al promotor que pueden afectarlo.
-Son solo ácidos nucleicos. -500 a 1000 pares de bases. |
Enhancer trans
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Cofactor enzimático que acompaña a un factor transcripcional.
Se encuentran lejanas al promotor. Pueden ser nucleótidos o enzimas. |
Cistrón
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Sinónimo de gen
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SNP
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Polimorfismo de un solo nucleótido.
Ocurre entre el 1 y 2% de la población |
Mutación
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Ocurre en menos del 1% de la población
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Estudio porfiláctico
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Estudio preventivo, se basa en los SNP's
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Superenrollamiento positivo
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Existen más vueltas en la hélice, mucha presión.
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Súper enrollamiento negativo
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La cadena está más abierta y relajada.
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Nucleasas
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Degradan ácidos nucléicos
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Retrotranscripción
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Formación de DNA complementario a partir de RNA
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¿Para qué sirve una proteína?
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Comunicación celulae, actividad catalítica, etc.
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Endonucleasas
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Mellan los enlaces fosfodiéster
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Corte romo
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Realizado por la endonucleasa.
Es un corte recto. |
Corte cohesivo
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Corte realizado por las endonucleasas.
Es un corte escalonado |
Centrómero
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Permiten el alineamiento de las cromátides
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Cromátides
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Constituyen a los cromosomas
Cada cromátide tiene una cadena doble |