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¿Cómo se encuentra distribuido el ADN eucariota?
En diferentes cromosomas
¿De qué están formados los cromosomas?
Están formados por ADN asociados a proteínas que se llaman cromatinas
¿Qué tipos de proteínas cromosómicas tenemos?
- Las histonas; estructurales
- Las no histonas; expresión, replicación y reparación
¿Qué longitud tiene el núcleo donde se encuentra el ADN?
5-10µm, y el ADN humano mide 2 metros
¿Cómo cabe el ADN en el núcleo?
Hay diferentes mecanismos de empaquetamiento; encontramos los cromosomas interfásicos con un empaquetamiento 500 veces + pequeño y los mitóticos con un empaquetamiento de 10000
¿Cómo se divide el cromosoma interfásico?
- Nucleosoma; cadenas o fibras de 11 nm
- Fibra de 30 nm
- Bucles de fibra de cromatina; 300nm
¿De qué está formado el cromosoma mitótico?
Formado por cromátidas de 700 nm
¿Cuándo se descubrieron los cromosomas?
En 1974
¿Qué son los nucleosomas?
Son estructuras dinámicas que facilitan el acceso a secuencias específicas y que permiten el trafico de la maquinaria proteica; nivel más básico de empaquetamiento de la cromatina
¿Qué tienen los nucleosomas?
- Núcleo proteico de histonas
- ADN (nucleosomal y espaciador)
¿Qué realizan los nucleosomas?
- Reducen la longitud original a 1/3 de la cromatian
¿Cuántos nucleosomas contiene cada célula?
Contiene 30 millones
¿De qué está formado el núcleo del nucleosoma?
Está formado por:
- Un octámero proteico (2 moléculas de histonas H2A, H2B, H3 y H4)
- ADN de doble cadena de 147 pares de bases
¿Qué son las histonas?
Son proteínas de 120-135 nm aminoácidos con una secuencia muy conservada y una función estructural
¿Qué tienen las histonas?
Tienen una región de plegamiento de histona con 3 hélice alfa y una cola terminal N
¿Cuándo son sintetizadas y ensambladas las histonas?
En la fase S
¿Qué ocurre en las variantes de histonas?
Son sintetizadas y ensambladas mediante enzimas remodeladoras
¿Qué determinan las variantes de histonas?
Determinan diferentes funciones biológicas:
- Daño y reparación del ADN
- Ensamblaje en el cinetocoro
¿Qué histonas intervienen en el ensamblaje del nucleosoma?
H2A, H2B, H3 y H4
¿Cómo se ensamblan los nucleosomas?
- Formación de dímeros H3-H4 / H2A-H2B
- Formación del tetrámero H3-H4 y se une al ADN
- Incorporación de los dos dímeros H2A y H2B en el tetrámero
¿Cómo es la estructura de las histonas?
Es en forma de disco y alrededor de 1'7 vueltas de ADN
¿Hacía donde está enrollado el ADN?
Hacía la izquierda
¿Cómo es la interfase histonas-ADN?
- Es extensa
- Con 142 enlaces de hidrógeno
¿Qué ocurre en la interfase histonas-ADN?
- Unión de aminoácidos básicos de histonas con esqueleto fosfodiéster ADN
- Una compresión del surco menor cuando se enrolla
- Las secuencias ricas en A-T (solo 2 puentes de hidrogeno) se comprimen más fácilmente
¿Qué es el CENP-A?
Es la región del centromero que ayuda a que este sea activo y sea reconocido por el cinetocoro para que se produzca la separación de las cromatidas hermanas en la mitosis
¿Cómo es el movimiento de los nucleosomas?
Es de wrapping y unwrapping en el cual el ADN se desenrolla 4 veces por segundo
¿Qué realizan lo complejos remodeladoras del nucleosoma?
- Catalizan el desplazamiento de los nucleosomas
- Suprimen parte o todo el núcleo del nucleosoma y cambian por otro; recambio de histonas
¿Cómo son los complejos remodeladoras de nucleosoma?
Son dependientes de ATP
¿Qué sigue la fibra de cromatina de 30 nm?
Sigue un modelo de empaquetamiento de zigzag e interacciona con nucleosomas alternos
¿Para que son necesarias las colas de las histonas?
Para la formación de fibra de 30nm
¿Cómo se forma la fibra de 30nm respecto a las colas de las histonas?
Las colas entran en contacto con el núcleo de las histonas, del nucleosoma adyacente
¿Qué hacen las colas de las histonas?
- Dan estabilidad
- Disposición hacía afuera del nucleosoma continuo; tocándolo
¿Qué es la histona H1?
Es la histona de mayor tamaño y poco conservada, imprescindible para la formación de fibra de 30nm y provoca un cambio de sentido en el ADN
¿Dónde se coloca la histona H1?
En la salida del ADN
¿Cómo es la histona H1?
Es una región globular con dos colas (por las que se une el ADN) con una C-termino con carga positiva
¿Qué es el bucle de cromatina?
Es el nivel máximo de empaquetamiento de cromosoma interfásico
¿Qué forma el bucle de cromatina?
Forma dominios en bucle de 50.000-200.000 pares de nucleótidos
¿Cómo está el bucle de cromatina?
Está condensado y anclado a una base proteica; armazón (anclaje y condensación)
¿Qué tiene el bucle de cromatina?
Tiene unas secuencias de unión específicas para las SAT
¿De qué está formado el armazón proteico?
- De proteínas no-histonas que se extraen de la cromatina
- Condensinas + Proteínas HMG + Topoisomerasas II
¿Cómo funciona el armazón proteico?
Funciona como soporte y también está implicado en la replicación, transcripción y reparación
¿Qué tiene el armazón proteico?
Tiene un bajo contenido en aminoácidos hidrofóbicos y una alta movilidad electroforética
¿Qué realizan las condensinas?
Condensan ADN
¿Qué realizan las proteinas HMG?
Desenrollan el ADN
¿Qué realizan las topoisomerasas II?
Producen cortes de ADN
¿En qué momento se usan las condensinas?
En la replicación y la transcripción
¿En qué momento se usan las proteinas HMG?
En la replicación y la transcripción
¿En qué momento se usan las topoisomerasas II?
En la replicación y la reparación
¿En qué momento se usa el cromosoma mitótico?
En la mitosis
¿Qué diferencia la cromatina del cromosoma mitótico?
El grado de empaquetamiento, el mitótico tiene un empaquetamiento superior al de la cromatina; hasta la metafase
¿A qué está asociada la cromatina?
A un armazón proteico condensado
¿Cuáles son las funciones del empaquetamiento?
- Permitir la alineación de la cromátidas hermanas
- Proteger la información genética de romperse
¿Qué son las condensinas?
Son proteínas no-histonas de la familia SMC
¿Qué se puede usar para reconocer proteínas?
Anticuerpos
¿De qué están formadas las condensinas?
Por dos subunidades SMC unidas por un dominio bisagra o hinge
¿De qué son dependientes las condensinas?
Son dependientes de ATP
¿Qué producen las condensinas?
La hidrolisis en un dominio ATP
¿De qué se encargan las condensinas?
Se encargan de plegar las moléculas de ADN formando diferentes modelos de compactación
¿Cuáles son los niveles de empaquetamiento?
ADN -> Histonas -> Cromatina de 11 nm -> Cromatina de 30 nm -> Estructuras en forma de bucle 30 nm -> Estructura de comprensión de diversas unidades -> Sistema de cromatita, estructura compresa -> Cromosoma
¿Qué junta el centrómero?
Junta una cromátida hermana con otra
¿Cómo es la regulación de la estructura de la cromatina?
Depende según si es la heterocromatina y la eucromatina
¿Cómo es la regulación de la estructura de la cromatina en la heterocromatina?
Es más empaquetada con centrómeros y telómeros, pobre en genes y silencia los genes
¿Cómo es la regulación de la estructura de la cromatina en la eucromatina?
Es más laxa, más rica en genes y permite la expresión génica
¿Cómo pueden ser modificadas las histonas?
Mediante alteraciones covalentes reversibles en las colas N-terminal
¿Cuáles son las modificaciones de las histonas más frecuentes?
- Alteraciones en las lisinas; grupo acetilo en una lisina
- Mono, di, tri metilaciones a las lisinas o argininas; excluyentes
- Fosforilaciones de serinas o treoninas
¿Cuáles son las enzimas que modifican las histonas?
- HAT
- HDAC
- HMT
- HDM
- Quinasas o fosfatasas de histonas
¿Qué ocurre con las modificaciones de las histonas?
Son reconocidas y pueden inducir a un empaquetamiento de la cromatina que corresponde a un silenciamiento génico y al acceso del ADN, condiciona una expresión génica
¿Qué reconocen los complejos multiproteicos?
Reconocen una combinación específica de marcaje de histonas; complejo lector
¿Qué es el complejo lector?
Es el complejo multiproteico que reconoce modificaciones en la cola de las histonas
¿Qué hace la proteína reguladora?
Activa o inhibe el ciclo
¿Qué puede ser la proteína escritora?
Una histona acetilada, metilada...
¿Cuál es el resultado del ciclo del complejo lector?
Es el complejo lector- escritor- remodelador
¿Qué permite el sistema de lectura el ciclo del complejo lector?
Crear una regulación de la expresión génica
¿Qué se debe realizar si se quiere descondensar la cromatina y aumentar la transcripción génica?
Se debe producir una acetilación en las lisinas; modificaciones químicas de la cola de las histonas
¿Qué se debe realizar si se quiere realizar un silenciamiento génico?
Se debe producir una desacetilación de lisinas y la metilación; condensación de la cromatina
¿Qué puede bloquear el complejo lector-escritor?
El mecanismo de acción de barrera
¿Cómo funciona el mecanismo de acción de barrera?
Las secuencias de ADN donde se anclan las proteínas barrera, bloquean la expansión del complejo lecto-escritor-remodelador y separa los dominios de cromatina
¿Cuáles son las proteínas barrera?
- Las que se anclan en el poro nuclear
- Las que se unen a un grupo de nucleosomas
- Las que borran el marcaje necesario para la difusión del complejo
¿Qué es la epigenética?
Es el estudio sobre aquellos factores no genéticos que intervienen en la determinación de la ontogénia o el desarrollo de un organismo
¿En qué interviene la epigenética?
En la regulación de la expresión sin cambio en la secuencia de nucleótidos y es hereditable
¿A qué afectan las lesiones epigeneticas?
Afectan a la capacidad de la célula para cambiar su fenotipo
¿Cómo afectan a su fenotipo las lesiones epigeneticas?
- Sobreexpresando los genes; duplicación del gen acetilación
- Silenciando los genes; mutación en la metilación
¿Cuáles son las enfermedades epigeneticas?
Varias, en especial el cáncer
¿Cómo se desarrolla el cáncer?
Mediante un silenciamiento de genes supresores de tumores o a la activación de la oncogénesis
¿Qué ocurre con el envejecimento en las enfermedades?
Ocurren más metilaciones; pérdida de plasticidad en respuesta a los cambios ambientales