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Características estructurales de los aminoácidos
Grupo amino y grupo carboxilo unidos al mismo átomo de Carbono (a1)
varían en su cadena lateral.
Único aminoácido cuyo carbono no es un centro quiral
Glicina
Aminoácidos esenciales (9)
Histidina (His)
Isoleucina (Ile)
Leucina (Leu)
Lisina (Lis)
Metionina (Met)
Threonina (Thr)
Triptofano (Trp)
Valina (Val)
Fenilalanima (Phe).
Aminoácidos no esenciales (5)
Alanina (Ala)
Asparagina (Asn)
Aspartato (Asp)
Glutamato (Glu)
Serina (Ser).
Aminoácidos condicionalmente esenciales (6)
Arginina (Arg)
Cysteína (Cys)
Glutamina (Gln)
Glicina (Gly)
Prolina (Pro)
Tyrosina (Tyr).
Ejemplos de No polares con R alifático
Glicina, alanina, prolina (cíclica), Valina, leucina, isoleucina, metionina (S).
No polares con R alifático
Hidrofóbicos
se agrupan en lo interno de las proteínas estabilizando su estructura.
Grupos R aromáticos
relativamente no polares
pueden participar en interacciones hidrofóbicas.
Ejemplos de aminoácidos R aromáticos
en orden de polaridad de mayor a menor: tirosina, triptofano y fenilananina.
Polares con grupos R no cargados
Contienen grupos OH y NH que forman puentes de H
CISTINA (muy hidrofóbica), importante en estructura de muchas proteínas.
Ejemplos de Polares con R no cargados
Serina, Asparagina, glutamina, cisteína, threonina.
Polares con R cargados
altamente hidrofílicos
enlaces iónicos uuy puentes de hidrógeno
esenciales en el mecanismo catalítico de muchas enzimas.
Ejemplos es de polares con R cargados NEGATIVAMENTE
Aspartato y glutamato
2 grupo carboxilo en R.
Ejemplos de polares con R cargados POSITIVAMENTE
Lisina, histidina y arg.inina
2 grupo amino en R.
aminoácidos no proteogénicos? ejemplos?
que no forman parte de proteínas, pero son importantes en el metabolismo
4-hidroxiprolina y 5-hidroxilisina (presentes en el colágeno).
Qué es un Zwitterion
una molécula con carga neta 0
a pH neutro un aminoácido disuelto en agua se comporta así.
Cuántas fases tiene la curva de disociación de un aminoácido... y a qué corresponde
2 fases, a la desprotonación del grupo carboxilo y del grupo amino.
Qué es el punto isoeléctrico? cómo se calcula?
pH en el cual se alcanza la desprotonación total del grupo carboxilo del aminoácido, convirtiéndolo en Zwitterion
En aminoácidos que no tienen más grupos ionizables se calcula como un promedio de las pK1 y Pk2
Qué significan pk1 y pk2? en la curva
Pk1:ph donde se desprotona el 50% del grupo carboxilo
pk2: ph donde se desprotona el 50% del grupo amino.
Hay aminoácidos que tienen otro grupo ionizable en su cadena R, los polares cargados.. cuántas fases tendrá la curva?
tendrá 3 puntos de ionización (3pk).
Cómo se cálcula el punto isoeléctrico en aminoácidos polares cargados?
positivos: promedio de Pkr y Pk2
negativos: Promedio de Pkr y PK1
qué son Proteínas? qué enlaces tienen?
Instrumento molecular mediante el cuál se expresa la información genética
cadenas de aminoácidos (residuos) de tamaño variable unidos mediante enlaces peptídicos.
Funciones de las proteínas
Participan en todos los procesos que toman lugar en las células
Enzimas, hormonas, anticuerpos, transporte, fibras musculares, lentes oculares, antibióticos, venenos de serpientes.
De qué depende el comportamiento ácido base de las proteínas?
de sus grupos terminales y la naturaleza ionizable de sus grupos R, cada proteína tiene un punto isoeléctrico característico.
Describa a las proteínas conjugadas
tienen grupos químicos no proteicos asociados de forma permanente a la cadena de aminoacidos
la parte nno aminoacidica se llama grupo prostético y la aminoacidica apoproteína.
Describa la estructura primaria de una proteína
es la secuencia de aminoácidos
determina los demás niveles de empaquetamiento tridimensional de una proteína
alteraciones en esta estructura pueden tener grandes repercusiones en su función.
qué es una conformación en proteínas?
arreglo espacial de átomos en la proteína.
Qué es estabilidad en proteínas?
tendencia a mantener una conformación (funcionalidad)
determinada por los diferentes niveles estructurales
las fuerzas intermoleculares aumentan la estabilidad porque son las más abundantes.
Describa la estructura secundaria de las proteínas?
la conformación local en un segmento determinado de polipéptido
las + comunes son las a helice, conformaciones B y giros B
en ciertas regiones arreglos irregulares.
Cómo son las alfa hélices?
conformación secundaria más simple que un polipéptido puede adoptar
predominantes en alfa queratinas
hace uso óptimo de enlaces hidrógeno.
Cómo son las hojas beta?
extendida y en zig zag
los enlaces de hidrógeno se forman entre segmentos adyacentes de la cadena
antiparalelas y paralelas.
Cómo son los giros beta?
casi un tercio de los residuos están de esta forma en proteínas globulares
conecta alfa hélices y hojas beta
muy común glicina y prolina.
Cómo son los arreglos irregulares?
estructuras indefinidas (sin estructuras periódicas) y estables de gran importancia.
Describa la estructura supersecundaria en proteínas?
arreglos estables comunes de dos o más elementos de estructura secundaria y sus elementos conectores

también llamados motivos

Desde muy simples hasta muy complejos.
Describa la estructura terciaria en las proteínas?
Ordenamiento tridimensional de todos los átomos que componen una proteína
Interacción entre aminoácidos alejados o en otro tipo de estrutura secundaria
DETERMINA LA FUNCIÓN PROTEICA.
Describa la estructura cuaternaria en proteínas?
Producto de la interacción entre 2 o más subunidades (monómeros)
subunidades pueden ejecutar funciones iguales o no
no todas llegan a este nivel.
Definición de subunidades
subunidades: son cadenas polipeptídicas distintas, se sintetizan de manera independiente (cuaternaria).
Definición de dominios
dominios: son unidades estructurales estables perp que forman parte de la misma cadena polipeptídica (terciaria).
Secuencias conservadas o secuencias consenso
algunas regiones que contienen secuencias cruciales para sus funciones biológicas.
Homólogos
miembros de una misma familia de proteínas.
Parálogos
cuando 2 proteínas de la misma familia están presentes en la misma especie.
Ortólogos
cuando 2 proteínas de la misma familia están presentes en especies distintas.
Función y características de Proteínas fibrosas
Función estructural, dan resistencia, flexibilidad , forma y protección

hebras largas, insolubles en agua
poseen un solo grupo de estructura secundaria.
Ejemplos de proteínas fibrosas
Keratina, fibra de seda, colágeno de tendones.
Función y características de proteínas globulares
Enzimas, proteínas de transporte, proteína reguladoras (hormonas), inmunoglobulinas

Segmentos de la cadena polipeptídica se pliegan sobre sí mismos, los aminoácidos hidrofílicos quedan en exterior.
Desnaturalización de proteínas
consiste en la pérdida total o parcial de la estructura 3D, pierde función
ocurre por calor (interacciones débiles), o cambios de ph (altera carga neta de la proteína)